61.5 Indo além da linguagem de programação para a Ecologia
69Análises Multidimensionais
71.6 Como usar este livro
70Pré-requisitos do capítulo
81.7 Como ensinar e aprender com esse livro
719.1 Aspectos teóricos
91.8 Livros que recomendamos para aprofundamento teórico
729.2 Análises de agrupamento
10Voltando ao básico: como dominar a arte de fazer perguntas cientificamente relevantes
739.3 Análises de Ordenação
112.2 Perguntas devem preceder as análises estatísticas
749.4 Ordenação irrestrita
122.3 Fluxograma: Conectando variáveis para melhorar o desenho experimental e as análises estatísticas
759.5 Ordenação restrita
132.4 Questões fundamentais em etnobiologia, ecologia e conservação
769.6 PERMANOVA
142.5 Considerações Finais
779.7 Mantel e Mantel parcial
15Pré-requisitos
789.8 Mantel espacial com modelo nulo restrito considerando autocorrelação espacial
163.2 Instalação do R
799.9 PROCRUSTES e PROTEST
173.3 Instalação do RStudio
809.10 Métodos multivariados baseados em modelos
183.5 Pacotes
819.12 Exercícios
193.6 Dados
82Rarefação
20Introdução ao R
8310.1 Aspectos teóricos
214.2 R e RStudio
8410.2 Curva de rarefação baseada no indivíduo (individual-based)
224.3 Funcionamento da linguagem R
8510.3 Curva de rarefação baseada em amostras (sample-based)
234.4 Estrutura e manipulação de objetos
8610.4 Curva de rarefação coverage-based
244.5 Para se aprofundar
8710.5 Para se aprofundar
254.6 Exercícios
8810.6 Exercícios
26Tidyverse
89Estimadores de riqueza
275.1 Contextualização
9011.1 Aspectos teóricos
285.2 tidyverse
9111.2 Estimadores baseados na abundância das espécies
295.4 readr, readxl e writexl
9211.3 Estimadores baseados na incidência das espécies
305.5 tibble
9311.4 Interpolação e extrapolação baseadas em rarefação usando amostragens de incidência ou abundância
315.6 magrittr (pipe - %>%)
9411.6 Exercícios
325.7 tidyr
95Diversidade Taxonômica
335.8 dplyr
9612.2 Diversidade alfa
345.9 stringr
9712.3 Diversidade beta
355.10 forcats
9812.4 Para se aprofundar
365.11 lubridate
9912.5 Exercícios
375.12 purrr
100Diversidade Filogenética
385.14 Exercícios
10113.1 Aspectos teóricos
39Visualização de dados
10213.2 Manipulação de filogenias
406.1 Contextualização
10313.3 Métricas de diversidade alfa filogenética
416.2 Principais pacotes
10413.4 Métricas de diversidade beta filogenética
426.3 Gramática dos gráficos
10513.5 Modelos Nulos
436.4 Tipos de gráficos
10613.6 Para se aprofundar
44Bookmark 1
10713.7 Exercícios
456.5 Finalização de gráficos para publicação
108Diversidade Funcional
466.7 Exercícios
10914.1 Aspectos teóricos
47Modelos lineares
11014.2 Definindo a dis(similaridade) entre espécies
48Pré-requisitos do capítulo
11114.3 Métricas de diversidade funcional (alfa)
497.1 Teste T (de Student) para duas amostras independentes
11214.4 Métricas de diversidade funcional (beta)
507.2 Teste T para amostras pareadas
11314.5 Composição Funcional (Community Wegihed Means - CWM)
517.3 Correlação de Pearson
11414.6 Variação Intraespecífica
527.4 Regressão Linear Simples
11514.7 Para se aprofundar
537.5 Regressão Linear Múltipla
11614.8 Exercícios
547.6 Análises de Variância (ANOVA)
117Dados geoespaciais
557.7 Generalized Least Squares (GLS)
118Pré-requisitos do capítulo
567.8 Para se aprofundar
11915.2 Vetor
577.9 Exercícios
12015.3 Raster
58Modelos Lineares Generalizados
12115.4 Sistema de Referência de Coordenadas e Unidades
598.1 Introdução
12215.5 Principais fontes de dados geoespaciais
608.2 Como um GLM funciona?
12315.6 Importar e exportar dados geoespaciais
618.4 Dados de contagem: a distribuição de Poisson
12415.7 Descrição de objetos geoespaciais
628.5 Dados de contagem: modelos quasi-likelihood
12515.8 Reprojeção de dados geoespaciais
638.6 Dados de contagem: a distribuição binomial
12615.9 Principais operações com dados geoespaciais
